晚清末年，社会动荡，深宫之中，文渊阁里净坛密藏宝图失窃，为争夺这份几乎能改天换地的宝藏，各方势力蠢蠢欲动。而曾接的御前带刀侍卫门三刀（秦俊杰 饰），也被内务府派遣，寻回宝图，并揪出背后势力。此时，天津大沽县内，一家客栈突发命案，从日本回来的九人无一生还，死状惨烈。因废除科举而弃笔从戎的县衙捕快王地保（庞瀚辰 饰）赶到现场，学识丰厚的他通过死者伤痕和作案手法，当场便判断出此案乃是棱西一带融天岭门人犯下，为了将凶手缉拿归案，王地保不顾县衙反对独自追凶。
好赌成性的卓尚文与程嘉鸣乃宿命冤家，尚文不仅拖累嘉鸣亏掉多年积蓄，更间接令她遭未婚夫抛弃。甘量宏乃航空业巨子甘树培的独子，集万千宠爱于一身。机缘巧合下，量宏结识了程家雄，成为交心挚友。嘉鸣辗转认识了树培之弟甘树生，并结为夫妻。 另一方面，量宏的真正身份在一次意外中遭揭破，原来程家雄才是树培的一脉单传！当年家雄母顾玉媚惨被树培因奸成孕，玉媚因无力抚养亲子量宏，逼得将他与孽种家雄掉包，由树培养育成人。早已习惯豪门生活的量宏为维持现有的一切，不择手段逼害家雄。家雄能否安全脱险？而量宏的奸计又会否得逞？
改编自豆瓣阅读同名小说《天蓝蓝》，苏明和顾俊是警校的同班同学，两人毕业后开始了不同的人生轨迹和爱情，然而有一天，苏明突然被停职，就此消失。顾俊本以为他们的不同仅仅是因为阶级的差别，然而随着案情推进，顾俊才发现隐藏在苏明身上的秘密。耀眼的阳光透出层层阴霾，让一切清澈见底。我们也许不会和黑暗势力真枪实弹，而我们都有可能遇到你所爱非人的质问……
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
该剧是NHK的第108部晨间剧，是以日本植物学之父牧野富太郎为原型的故事，由长田育惠担任编剧，渡边良雄、津田温子担任导演，阿部海太郎担任剧中音乐。 滨边美波饰演本剧的女主角、主人公槙野万太郎（神木隆之介 饰）的妻子寿惠子。
