该剧改编自岩明均的同名漫画。讲述一名虚幌度日的佛系大学生南丸洋二（细田佳央太 饰），意外发现自己拥有一个看似无用武之地的超能力 — 他可以在任何物体上“穿洞”。南丸洋二的朋友们总亲切地称呼人畜无害的他为“小丸”，而南丸也在看似一成不变的生活中，赫然发现自己被卷入一个可能毁灭世界的恐怖灾难，而唯有自己看似毫无用处的超能力可以帮助他克服这场危机。
二十一集电视系列剧《命案十三宗》取材于近几年发生的十三宗真实命案，经改编创作而成，主要情节与人物都是真实的。摄制组对这十三宗命案的凶犯做了三十多个小时的电视采访记录，并将这些采访作为一个部分放在剧中，与故事情节有机地结合成一个完整的影片。他们都说肯定不想杀人，但又承认自己后来确实杀了人，那是怎样的过程？是什么因素造成了惨剧的发生呢？他们绝非成心作恶之人，使他们走到这一步的就是人类所共有的人性弱点，自私、嫉妒、无知、狭隘、愚昧……断送了他们原本平静幸福的生活。被他们杀害的人痛苦地死去了，他们还活着，却没有了快乐。我们可能也曾面临过困境、也曾受到过伤害和由此产生的反抗，那种维护尊严的欲望和这些杀人者都是相同的，甚至更强烈。但有所不同的是，他们都采取了一种错误的方式。企图摆脱那种困境，却不料将自己置身于一个根本无法挽回的绝境，剥夺了给自己造成困境的人的生命，成了一名杀人犯。于是他们成了故事中的人。
百乐门头牌陆花颜（杨紫艺 饰）为姐姐复仇而来，遇到来自异世界“无间”的李墨瞳（申浩男 饰），他为寻找让“无间”永存的法宝必须杀死人间歌女陆花颜，可意外发现她是他前世的爱人，爱恨纠葛相爱相杀就此开始。
南海水下考古队“06”号勘测船开赴南海海域，对一艘满载着元代瓷器的沉船进行最后的勘察定位。当晚，“06”号勘测船在目标海域停泊时，被一艘不明国籍的货轮撞毁，12名队员中，只有王辞和彭湖两人在海上漂泊72小时后获救，其余船员均不幸遇难。王辞和彭湖认为事故背后有着不可告人的阴谋，便联手遇难者杨雄的女友——记者萧娅在一本小说的指引下展开调查。随着调查的深入，与事件有关的人一个一个进入他们的视线：徐福、黄炳、尤利、阮佑龙、马怀山……究竟谁才是真正的幕后凶手？然而，总有人在暗中监视他们的行踪，每一个为他们提供线索的人都离奇地死亡，更有人布置下天罗地网想要置他们于死地，危机四伏的追凶之路上隐藏着巨大的阴谋，却也更加坚定了三人查清事实真相的决心。一次次的峰回路转、一次次的柳暗花明，一次次的功亏一篑，其中，有为金钱的背叛、有为爱情的牺牲、也有种种爱恨情仇的纠葛……最后，正义之剑终于架到了真凶马怀山的脖子上……令人难以相信的是，马怀山一世阴谋的背后竟然隐藏着另一个悲剧故事……
仁和医院高级精神科医生高立仁（方中信 饰）在婚礼前痛失为重案组探员的未婚妻莫敏儿（徐子珊 饰），随即陷入悲伤中不可自拔，甚至为此辞去工作。却不料就在此时，医院接收了一名声称被幻听所困更涉嫌强奸案的精神分裂患者。对此案不甚关心的高立仁路过案发现场，误打误撞帮助了博安医院法医精神科医生梁启荣（萧正楠 饰），并建立亦师亦友的关系。已经在外挂牌行医的连志森（蒋志光 饰）担心老友丧妻后萎靡不振的精神状态，多番劝说他重振旗鼓。高立仁也终于决定去博安医院任职。
孤儿王小米虽然貌不出众，却是个乐观向上、充满正能量的可爱女孩。她一直暗恋着摄影奇才、帅气师哥杨家磊，而杨家磊爱的却是美籍交换生陈安妮。大学毕业，杨家磊为了留住陈安妮，精心策划了一场婚礼，王小米得知杨家磊要结婚的消息伤心欲绝。婚礼当天，陈安妮因恐婚落跑，情急之下身穿礼服的王小米阴差阳错被当成了新娘，由此便和杨家磊有了无法割舍的情缘。王小米善良、孝顺、重感情、识大体，不仅打动了杨家磊的父母，也渐渐融化了杨家磊内心的坚冰，两人终于假戏真做、结为夫妻。没想到的是，落跑新娘陈安妮突然出现。一边是当年深爱的恋人，一边是相濡以沫的妻子，杨家磊陷入矛盾中，王小米却用她的宽容和智慧，引导着杨家磊心甘情愿地回归家庭。
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一桩20年未破解的少女谋杀谜案在20年后同样案件再度发生，它唤起了似乎已经平静的小城人们的记忆，曾经年少的山峰（宋洋饰演）成长为警察回到小城。因无法抹去的痛苦记忆让山峰再度追凶，在他寻求真相的过程中发现不仅仅自己，所有当年牵涉其中的人都因这桩20年前的谜案产生了翻天覆地的变化。江边小城夜色如水，雾气弥漫的追凶路上，一次次人性的拷问，一场场预想不到的危机与答案。
八零年代末，孤女林晓筱（宗元圆 饰）被姑姑逼婚换彩礼，绝境时奋力反抗改写自己的命运。她勇闯羊城，从当饭店服务员嗅到商机榨出第一桶金，再踏足服装界，扛过流氓刁难、受过同行暗算，与大少爷梁恪青（吴竹熙 饰）击碎重重阴谋。从梅江孤女到商界新星，她的逆袭里，藏着所有追梦者的热血与光芒！
作为一个平凡而普通的人，我没有故事可以分享，别人的故事都很精彩，而我，从小就被爸妈教育要向“别人家的孩子”学习。别人家的孩子出国留学，别人家的孩子找到了工作，我也想成为爸妈口中“别人家的孩子”，但我的人生平凡得好像一张白纸，没有任何精彩的故事，错过了暗恋，错过了早恋，错过了校园最美好的时代，至今仍是母胎solo。我大学读的是动物行为学，非常热爱各种小动物，经常帮小区里的宠物义务看病，小区邻居也经常将宠物寄养在我家。因为内心一直渴望一段恋情，有天，在我极力渴望的意志下，一”群”哥哥突然出现了.......
5年前，殷婷（苏玉华饰）在台湾因杀害丈夫刘启忠（温兆伦饰）而被判刑，因行为良好5年后被提早释放。回到香港的她挣扎着开始新的生活，在热心帮助母亲的罗理浩（林保怡饰）律师手下做事。未几，发现与丈夫长得一模一样的阮文山（温兆伦饰），现在俨然是天堃太子女的未婚夫，在殷婷的纠缠下，阮文山处处证明了自己并不是她丈夫。当淑娴带着儿子从美国回港那天起，事情的真相被逐渐揭开，她喊文山老公，而孩子喊他爸爸，5年前的罪恶被重新勾起。理浩的女儿患上了蚕豆症，这种带有遗传基因的病显示好友游尚志才是女儿的亲生父亲！这一真相的显现，令游尚志决定夺回自己的爱人与女儿，把理浩逼上绝路。殷婷与理浩决定反击，复仇。
