潘彬彬（陈浩民 饰）和秦芳（佘诗曼 饰）是艺术学院的同学，两人成长于完全不同的家庭之中。两人相遇、相知，并且最终双双坠入了情网中。两人不知道的是，他们彼此的父母曾是恋人。父母反对他们的爱情，只有秦芳的好友钱姗姗（薛佳凝 饰）支持他们。经历了重重考验后，潘彬彬和秦芳决定私奔，两人来到一个陌生的城市开始新的生活。然而，生活的艰辛不断冲击着他们，使他们身心疲惫。最终，潘彬彬受不了这种苦难，沦为了无业游民。潘彬彬并不知道的是，此时的秦芳已怀上了他们的孩子。
南宋时期，杭州灵隐寺住这一位疯癫和尚，人称济公，传说为罗汉转世。他本姓李，祖上乃宋太宗驸马。济公二十七岁出家，不戒酒肉，破衣拉撒，不知情者皆道其疯癫，却不知其实为得到高僧。济公济困扶危，惩治强梁，经常用一些诙谐的小法术教训那些欺压百姓、鱼肉乡民的奸佞恶霸。恶人提起他又恨又怕，百姓们则对济公师父爱戴有佳。
离异单身不再相信稳定关系的室内设计师张帆、正在经历感情七年止痒的金牌保险销售潘晓晨和从未经历过恋爱的大学研究生罗潇潇，三个年龄不同、性格迥异的主人公身处人生困境，她们怀疑过、犹豫过、挣扎过，最终决定直面生活、勇敢应战。在背叛、欺骗、陷阱面前，她们用真诚和坚持突破了生活的瓶颈，迎来了人生的高光时刻，遇见了更好的自己。
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
